Большинство людей делают в рамках своего проекта фитнес-проект, который содержит все приборы. Этот проект затем имеет ссылки на все необходимые проекты / DLL. Тогда вашему самому проекту пригодится просто объявление в classpath, где можно найти все. Пока вы не закодировали свою конфигурацию NHibernate в определенном месте, я бы подумал, что с вами все будет в порядке
Построить, запустить, повторить.