В файле с именем src/java.base/unix/native/libjava/FileOutputStream_md.c
есть две реализации, одна для unix и одна для Windows, обе выглядят так:
JNIEXPORT void JNICALL
Java_java_io_FileOutputStream_write(JNIEnv *env, jobject this, jint byte, jboolean append) {
writeSingle(env, this, byte, append, fos_fd);
}