выбрать столбцы из тепловой карты - PullRequest
Новая
       9

выбрать столбцы из тепловой карты

0 голосов
/ 26 февраля 2019

Я создал тепловую карту, используя этот скрипт: 

RPKM_df= data.frame(GENES= table_tot_tissues$genes, RPKM)
dat = RPKM_df[,-1]
datmatrix= as.matrix(dat)
heatmap_RPKM= heatmap.2(datmatrix, trace = "none", Colv=FALSE, dendogram = 'row', 
                        density = "none", col = bluered(20), 
                        cexRow = 0.6, cexCol = 0.9, margins = c(8,14), scale = "row", 
                        hclust =function(x) hclust(x,method = "average"))

, и я получил эту тепловую карту: enter image description here

, но теперь

  1. IДля сравнения необходимо извлечь только столбцы, называемые яйцеклетками и яичками.

  2. Выберите несколько кластеров генов (наиболее выраженных) для оценки экспрессии генов в обеих тканях.

...