Решение по OP.
Чтобы решить эту проблему, я открыл терминал и вручную скопировал difftool.sh
:
cp /Applications/SnailSVNLite.app/Contents/Applications/DiffTool.app/Contents/Resources/difftool.sh ~/Library/Application\ Scripts/net.langui.SnailSVN.DiffTool/