Сначала вы можете использовать простое регулярное выражение, чтобы найти все вхождения ,90
в строке:
/,90/g
А затем вы можете использовать String.prototype.replace()
для заменыэто с <sup></sup>
тегами:
str.replace(/,90/g, "<sup>90</sup>");
Демонстрация:
var str = "30,90 12,90 3,90";
str = str.replace(/,90/g, "<sup>90</sup>");
document.body.innerHTML = str;