Вы пропустили шаг, но также не используете пробелы в имени вашего проекта и нет необходимости в верхнем регистре для команд или имен путей
# this command will create a new project in a new relative folder
jekyll new healthcare-transition-toolkit
# then you need to cd into that folder
cd healthcare-transition-toolkit
На этом этапе ваши команды должны работать нормально
bundle exec jekyll serve
или
bundle exec jekyll build