Если вы знаете, какие индексы были созданы, вы можете щелкнуть правой кнопкой мыши по каждому индексу в SSMS и выбрать опцию Script Index -> As Create. Это создаст сценарий SQL - при запуске этого сценария в другой базе данных этот индекс будет воссоздан в этой базе данных.
Если вы не знаете, какие индексы были созданы, но помните, какие таблицы были затронуты, вы можете создать сценарий для этих таблиц. Это создаст еще больший скрипт, и вы сможете запускать только те части, которые вам нужны.