Я установил Spyder и anoconda, что позволило мне запускать spacy, но только в Spyder.Попробуйте, чтобы увидеть, можете ли вы бежать оттуда.
Обновление
Попробуйте использовать следующее вместо
pip install -U spacy
python -m spacy download en
Используйте это в своем коде:
import spacy
nlp = spacy.load('en')