Как преобразовать весь data.frame в числовой

Question

Я хочу преобразовать все data.frame, содержащее более 130 столбцов в числовые значения.

Я знаю, что мне нужно использовать as.numeric, но проблема в том, что мне нужно применять эту функцию отдельно ккаждый из 130 столбцов.Я пытался применить его ко всему data.frame, но получил следующее сообщение об ошибке:

Error: (list) object cannot be coerced to type 'double'

Как я могу сделать это с помощью относительно короткого кода?

Answer 1

В базе R мы можем сделать:

df[] <- lapply(df, as.numeric)

или

df[cols_to_convert]  <- lapply(df[cols_to_convert], as.numeric)

Вот эталон решения (игнорируя соображения о факторах):

DF <- data.frame(a = 1:10000, b = letters[1:10000],
                 c = seq(as.Date("2004-01-01"), by = "week", len = 10000),
                 stringsAsFactors = TRUE)
DF <- setNames(do.call(cbind,replicate(50,DF,simplify = F)),paste0("V",1:150))

dim(DF)
# [1] 10000   150

library(dplyr)
n1tk  <- function(x) data.frame(data.matrix(x))
mm    <- function(x) {x[] <- lapply(x,as.numeric); x}
akrun <- function(x) mutate_all(x, as.numeric)
mo    <- function(x)  {for(i in 1:150){ x[, i] <- as.numeric(x[, i])}}

microbenchmark::microbenchmark(
  akrun = akrun(DF),
  n1tk  = n1tk(DF),
  mo    = mo(DF),
  mm    = mm(DF)
)

# Unit: milliseconds
#   expr      min        lq       mean    median        uq      max neval
#  akrun 152.9837 177.48150 198.292412 190.38610 206.56800 432.2679   100
#   n1tk  10.8700  14.48015  22.632782  17.43660  21.68520  89.4694   100
#     mo   9.3512  11.41880  15.313889  14.71970  17.66530  37.6390   100
#     mm   4.8294   5.91975   8.906348   7.80095  10.11335  71.2647   100

Answer 2

Преобразование фрейма данных в числовую матрицу

, например, у нас есть этот фрейм данных:

DF <- data.frame(a = 1:3, b = letters[10:12],
                  c = seq(as.Date("2004-01-01"), by = "week", len = 3),
                  stringsAsFactors = TRUE)

> DF
  a b          c
1 1 j 2004-01-01
2 2 k 2004-01-08
3 3 l 2004-01-15

для преобразованияк числовому и иметь в качестве кадра данных, вы можете использовать:

DF2 <- data.frame(data.matrix(DF))

> DF2
  a b     c
1 1 1 12418
2 2 2 12425
3 3 3 12432

Примечание: вы можете нарезать столбцы данных в нужной области, если вам нужны определенные столбцы, например: «DF [1:3] ”

Answer 3

Спасибо, n1tk, ваше решение работает.Сначала я попытался использовать этот код:

for(i in 1:140){
  mydata[, i] <- as.numeric(mydata[, i])
}

Но я думаю, что ваше решение проще.

akrun, да, я знаю, что нам нужно сначала преобразовать коэффициенты в символ, а затем в число.

Answer 4

Опция с dplyr

library(dplyr)
df1 %>%
   mutate_all(as.numeric)

Если столбцы имеют класс factor, преобразуйте в character, а затем в numeric

df1 %>%
    mutate_all(funs(as.numeric(as.character(.)))

Также обратите вниманиечто если в какой-либо из ячеек нет элементов character, используйте type.convert в столбце character

df1 %>%
    mutate_all(funs(type.convert(as.character(.)))

---

Если эффективность имеет значение, один из вариантов будет data.table

library(data.table)
DF1 <- copy(DF) # from other post
system.time({setDT(DF1)
    for(j in seq_along(DF1)) set(DF1, i = NULL, j=j, value = as.numeric(DF1[[j]]))
  })
#   user  system elapsed 
#  0.032   0.005   0.037