Ошибка типа: объект типа 'numpy.int64' не имеет len () - PullRequest
Новая
       13

Ошибка типа: объект типа 'numpy.int64' не имеет len ()

0 голосов
/ 24 декабря 2018

Я делаю DataLoader из DataSet в PyTorch.

Начните с загрузки DataFrame со всеми dtype как np.float64

result = pd.read_csv('dummy.csv', header=0, dtype=DTYPE_CLEANED_DF)

Вот мои классы набора данных. 

from torch.utils.data import Dataset, DataLoader
class MyDataset(Dataset):
    def __init__(self, result):
        headers = list(result)
        headers.remove('classes')

        self.x_data = result[headers]
        self.y_data = result['classes']
        self.len = self.x_data.shape[0]

    def __getitem__(self, index):
        x = torch.tensor(self.x_data.iloc[index].values, dtype=torch.float)
        y = torch.tensor(self.y_data.iloc[index], dtype=torch.float)
        return (x, y)

    def __len__(self):
        return self.len

Подготовьте train_loader and test_loader

train_size = int(0.5 * len(full_dataset))
test_size = len(full_dataset) - train_size
train_dataset, test_dataset = torch.utils.data.random_split(full_dataset, [train_size, test_size])

train_loader = DataLoader(dataset=train_dataset, batch_size=16, shuffle=True, num_workers=1)
test_loader = DataLoader(dataset=train_dataset)

Вот мой csv файл

Когда я пытаюсь перебрать train_loader,Возникает ошибка 

for i , (data, target) in enumerate(train_loader):
    print(i)

TypeError                                 Traceback (most recent call last)
<ipython-input-32-0b4921c3fe8c> in <module>
----> 1 for i , (data, target) in enumerate(train_loader):
      2     print(i)

/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/torch/utils/data/dataloader.py in __next__(self)
    635                 self.reorder_dict[idx] = batch
    636                 continue
--> 637             return self._process_next_batch(batch)
    638 
    639     next = __next__  # Python 2 compatibility

/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/torch/utils/data/dataloader.py in _process_next_batch(self, batch)
    656         self._put_indices()
    657         if isinstance(batch, ExceptionWrapper):
--> 658             raise batch.exc_type(batch.exc_msg)
    659         return batch
    660 

TypeError: Traceback (most recent call last):
  File "/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/torch/utils/data/dataloader.py", line 138, in _worker_loop
    samples = collate_fn([dataset[i] for i in batch_indices])
  File "/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/torch/utils/data/dataloader.py", line 138, in <listcomp>
    samples = collate_fn([dataset[i] for i in batch_indices])
  File "/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/torch/utils/data/dataset.py", line 103, in __getitem__
    return self.dataset[self.indices[idx]]
  File "<ipython-input-27-107e03bc3c6a>", line 12, in __getitem__
    x = torch.tensor(self.x_data.iloc[index].values, dtype=torch.float)
  File "/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/indexing.py", line 1478, in __getitem__
    return self._getitem_axis(maybe_callable, axis=axis)
  File "/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/indexing.py", line 2091, in _getitem_axis
    return self._get_list_axis(key, axis=axis)
  File "/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/indexing.py", line 2070, in _get_list_axis
    return self.obj._take(key, axis=axis)
  File "/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/generic.py", line 2789, in _take
    verify=True)
  File "/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/internals.py", line 4537, in take
    new_labels = self.axes[axis].take(indexer)
  File "/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/indexes/base.py", line 2195, in take
    return self._shallow_copy(taken)
  File "/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/indexes/range.py", line 267, in _shallow_copy
    return self._int64index._shallow_copy(values, **kwargs)
  File "/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/indexes/numeric.py", line 68, in _shallow_copy
    return self._shallow_copy_with_infer(values=values, **kwargs)
  File "/opt/conda/lib/python3.6/site-packages/pandas/core/indexes/base.py", line 538, in _shallow_copy_with_infer
    if not len(values) and 'dtype' not in kwargs:
TypeError: object of type 'numpy.int64' has no len()

Связанные вопросы:
https://github.com/pytorch/pytorch/issues/10165
https://github.com/pytorch/pytorch/pull/9237
https://github.com/pandas-dev/pandas/issues/21946

Вопросы:
Как обойти проблему pandas здесь?

Ответы [ 3 ]

0 голосов
/ 26 декабря 2018

Почему бы просто не попробовать: 

self.len = len(self.x_data)

len отлично работает с pandas DataFrame без преобразования в массив или тензор.

0 голосов
/ 04 января 2019

Я думаю, проблема в том, что после использования random_split, index теперь является torch.Tensor, а не int.Я обнаружил, что добавление быстрой проверки типа к __getitem__ и последующее использование .item() для тензора работает для меня: 

def __getitem__(self, index):

    if type(index) == torch.Tensor:
        index = index.item()

    x = torch.tensor(self.x_data.iloc[index].values, dtype=torch.float)
    y = torch.tensor(self.y_data.iloc[index], dtype=torch.float)
    return (x, y)

Источник: https://discuss.pytorch.org/t/issues-with-torch-utils-data-random-split/22298/8

0 голосов
/ 25 декабря 2018

Ссылка:
https://github.com/pytorch/pytorch/issues/9211

Просто добавьте .tolist() к indices строке. 

def random_split(dataset, lengths):
    """
    Randomly split a dataset into non-overlapping new datasets of given lengths.
    Arguments:
        dataset (Dataset): Dataset to be split
        lengths (sequence): lengths of splits to be produced
    """
    if sum(lengths) != len(dataset):
        raise ValueError("Sum of input lengths does not equal the length of the input dataset!")

    indices = randperm(sum(lengths)).tolist()
    return [Subset(dataset, indices[offset - length:offset]) for offset, length in zip(_accumulate(lengths), lengths)]
...