Извлечение списка ребер с условиями из объекта igraph в R

Question

Я работаю с неориентированным объектом igraph, состоящим из узлов разных типов (например, мужчины M желтого цвета и женщины F оранжевого цвета):

g <- graph.atlas(711)
V(g)$name <- 1:7
V(g)$gender <- c("M","F","M","M","M","F","F")
V(g)$color <- ifelse(V(g)$gender=="F", "orange","yellow")
g<-delete.edges(g, E(g, P=c(1,2,2,3,2,7,7,6,7,3,3,4,3,5,4,5,5,6,6,1))) 
g<-add.edges(g,c(1,4,4,5,5,1,4,7,7,3,3,5,5,7,2,7,7,6,6,2,6,4))
plot(g)

Я хотел бы извлечь список ребер, состоящий изребра, соединяющие узлы разных типов (мужчин и женщин):

edgelist <- rbind(c(3,7),
               c(4,6),
               c(4,7),
               c(5,7))

assortativity использует долю ребер, соединяющих вершины типов M и F, но я не знаю, чтобы извлечь из этих ребер простоту.

get.edgelist возвращает только весь список ребер без возможности задания условий.

Answer 1

Вы можете использовать селектор %--%, чтобы найти ребра, которые соединяют охватывающие узлы с охватывающими узлами.Например,

E(g)[V(g)[gender=="M"] %--% V(g)[gender=="F"]]

V(g)[gender=="M"] находит все "мужские" узлы, V(g)[gender=="F"] находит все женские узлы, а %--% находит все ребра между двумя наборами.

Answer 2

edges = get.edgelist(g)
edges[rowSums(apply(edges, 2, function(x) get.vertex.attribute(g, "gender", x)) == "M") == 1,]
#     [,1] [,2]
#[1,]    4    7
#[2,]    3    7
#[3,]    5    7
#[4,]    4    6