Простая замена:
String s = "hey \r\n\r\n I am a robot \r\n I am a dog \r\n\r\n";
System.out.println("Original: " + s);
s = s.replace("\r\n\r\n", "\r\n");
System.out.println("Result: " + s);
напечатает:
Original: hey
I am a robot
I am a dog
Result: hey
I am a robot
I am a dog
и, если есть случай более чем 2 смежных вхождений "\r\n"
:
while (s.contains("\r\n\r\n")) {
s = s.replace("\r\n\r\n", "\r\n");
}