Вот решение, которое работает для этого изображения.Я использовал пол и потолок, чтобы избежать краев, и rmax должно быть больше 75.
[img,map] = imread('MwBQo.png','png');
img = ind2rgb(img, map);
figure;
imshow(img);
rmin = 10;
rmax = 80;
[centersDarkl, radiiDarkl] = imfindcircles(img,...
[rmin,rmax],'ObjectPolarity','dark','Sensitivity',0.80);
viscircles(centersDarkl, radiiDarkl,'LineStyle','--')
for iCirc = 1:size(centersDarkl,1)
cropped{iCirc,1} = img(...
ceil(centersDarkl(iCirc,2)-radiiDarkl(iCirc)):...
floor(centersDarkl(iCirc,2)+radiiDarkl(iCirc)),...
ceil(centersDarkl(iCirc,1)-radiiDarkl(iCirc)):...
floor(centersDarkl(iCirc,1)+radiiDarkl(iCirc)),:);
end
figure;
subplot(1,2,1)
imshow(cropped{1})
subplot(1,2,2)
imshow(cropped{2})