Насколько мне известно, нет способа изменить геометрию спрайта в Unity с прямоугольной формы.Я не эксперт по визуализации, но увеличение геометрии добавило бы ненужные накладные расходы в процесс рисования спрайтов.
Лучше всего отредактировать лист спрайтов в программе редактирования изображений, такой как Photoshop или GIMP, чтобывсе спрайты укладываются в форму сетки или, по крайней мере, в форму, где они не нарушают прямоугольные границы друг друга.