Поскольку вопрос не ясен, я сделаю некоторые дикие догадки.
public interface NextValRepository extends JpaRepository<YourEntity, Integer> {
@Query(value = "select nextval('db_seq_name')", nativeQuery = true)
public Integer nextVal();
}
И @AutoWired это везде, где вы хотите использовать следующее значение из последовательности.