Привет. Я пытаюсь воспроизвести некоторые примеры пакета UpSetR.Однако функция make_comb_mat, похоже, отсутствует.
library(UpSetR)
library(circlize)
library(GenomicRanges)
lt2 = lapply(1:4, function(i) generateRandomBed())
lt2 = lapply(lt2, function(df) GRanges(seqnames = df[, 1],
ranges = IRanges(df[, 2], df[, 3])))
names(lt2) = letters[1:4]
m = make_comb_mat(lt2)
set_size(m)
Ошибка в make_comb_mat (lt2): не удалось найти функцию "make_comb_mat" Ошибка в set_size (m): не удалось найти функцию "set_size"
Iдаже попытался указать пакет безуспешно:
UpSetR::make_comb_mat(lt2)
Ошибка: 'make_comb_mat' не является экспортированным объектом из 'пространства имен: UpSetR'
Реализована ли эта функцияв другой упаковке, не упомянутой в виньетке UpSetR (https://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/upset-plot.html)?