Я бы порекомендовал потратить время, чтобы убедиться, что проект не помешает такому разделению в будущем, но реализовать его как единую базу данных.
Пахнет преждевременной оптимизацией. Есть много мощных серверов баз данных, которые могут одинаково хорошо работать при высокой нагрузке. Тем не менее, существуют решения для репликации, которые можно выполнять в виде нескольких серверов с настраиваемой репликацией данных или внутренних данных, обращающихся к одному и тому же физическому хранилищу через оптоволокно.
Я думаю, вы сэкономите много потенциально ненужной работы, избегая этого на раннем этапе реализации вашего проекта. Но это не займет много времени, чтобы предвидеть метод, с помощью которого он может быть реализован в будущем (с помощью проектирования классов, 3-уровневой архитектуры или даже хранимых процедур базы данных (icky)).