Какой тип 3D-модели?Если вы используете ModelUIElement3D, вы можете прикрепить событие mousedown к обеим таким моделям.
model1.MouseDown += (sender,e) => CreateNewWindow("First");
model2.MouseDown += (sender,e) => CreateNewWindow("Second");
Затем вы можете открыть новое окно в соответствии с параметром, отправленным с помощью этой функции CreateNewWindow (string windowToOpen)