Действительно, как уже отмечалось, вы можете использовать надстройку taskscheduleR
Rstudio.У меня есть задачи, запланированные на каждый час, они отлично работают, и вы можете запустить свой скрипт напрямую (фактически с задержкой в одну минуту), чтобы проверить, правильно ли выполнено выполнение.