На основании вашего описания, вы можете просто сделать,
matrix(df$v, ncol = max(df$j))
# [,1] [,2] [,3]
#[1,] 2 4 7
#[2,] 3 1 5
#[3,] 8 6 9
Используемые данные:
dput(df)
structure(list(i = c(1L, 2L, 3L, 1L, 2L, 3L, 1L, 2L, 3L), j = c(1L,
1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 3L, 3L, 3L), v = c(2L, 3L, 8L, 4L, 1L, 6L,
7L, 5L, 9L)), class = "data.frame", row.names = c(NA, -9L))