Я не уверен, как заставить Emacs подобрать именно те серверы, которые были смонтированы под Nautilus.
Однако (и, надеюсь, это соответствует вашим потребностям), вы все равно можете просматривать и редактировать удаленные файлы и каталоги, используя Tramp, если вы знаете имя сервера:
C-x C-f /sftp:username@server.net:path/to/file.txt RET
или
C-x C-f /sftp:username@server.net:path/to/directory/ RET
Бродячая документация