Вы просто запускаете команду оболочки, поэтому вы можете использовать команду evaulation
Например, чтобы переименовать файл, чтобы он имел yyyy-MM-dd
hadoop fs -put \
'topic_2018-12-15%2016:31:15.csv' \
"/user/file_structure/topic_$(date +%Y-%m-%d).csv"