Использовать понимание вложенного списка с range
и выравнивание для списка кортежей, последнее использование DataFrame
Конструктор:
zipped = zip(df['id'], df['start'], df['end'])
df = pd.DataFrame([(i, y) for i, s, e in zipped for y in range(s, e+1)],
columns=['id','number'])
print (df)
id number
0 1 101
1 2 102
2 2 103
3 2 104
4 3 108
5 3 109