имена строк не отображаются в pca ggbiplot - PullRequest
0 голосов
/ 29 декабря 2018

Я написал следующие коды на r, код работает хорошо, показывает все точки без имени и стрелки с именами.

Код читает файл Excel, и структура файла такова, что все числа начинаются сот В2 влево и вниз.Первая строка содержит имена значений для каждого столбца, первый столбец содержит имена образцов.

, например:

blank    speed, weight, lenght
sample1    1      2       3
sample2    2      3       2

setwd("/Users/myname/Box/r/")    
library(readxl)    
fq <- read_excel("fq.xlsx", sheet = 1)    
fq.pca <- prcomp(fq[,c(2:11)], center = TRUE, scale. = TRUE)    
summary(fq.pca)    
str(fq.pca)    
library(ggbiplot)    
fq.fg <- ggbiplot(fq.pca, ellipse=TRUE, circle=TRUE)    
fq.fg

Но когда я собираюсь добавить данные, имя строки, используя:

ggbiplot(fq.pca, labels=row.names(fq))

отображаемое имя было номерами строк, а не именами первого столбца.

Как добавить имена (sample1, sample2, sample3) для каждой точки на рисунке биплота?

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...