Удаление ресурсов вручную не приведет к невозможности удаления стека CloudFormation.
Вам нужно будет просмотреть список ресурсов, которые, по его словам, еще не удалены.Причина обычно заключается в Elastic Network Interface (ENI) , который все еще подключен к VPC.Многие различные сервисы могут создавать ENI.
Нажмите Сетевые интерфейсы в консоли EC2, чтобы увидеть, является ли это причиной проблемы.