Вы определили действие средства запуска несколько раз.Удалите тег фильтра намерений из MainActivity, который не будет отображать MainActivity после установки.
TL; DR:
Заменить
<activity
android:name=".Users.MainActivity"
android:label="@string/title_activity_main"
android:theme="@style/AppTheme.NoActionBar"
android:windowSoftInputMode="adjustPan">
<intent-filter>
<action android:name="android.intent.action.MAIN" />
<category android:name="android.intent.category.LAUNCHER" />
</intent-filter>
</activity>
на
<activity
android:name=".Users.MainActivity"
android:label="@string/title_activity_main"
android:theme="@style/AppTheme.NoActionBar"
android:windowSoftInputMode="adjustPan">
</activity>