Вам не нужен приведенный ниже код, он удалит запись из вашей первой коллекции.
this.uncheckedData.splice(index, 1);
Если вы не хотите знать выбранные строки в более поздней точке, я бы предложил установитьIsSelected свойство
this.selection.selected.forEach(item => {
let index: number = this.uncheckedData.findIndex(d => d === item);
if(index){
this.uncheckedData[index].IsSelected= true;
this.checkedData.push(this.uncheckedData[index]);
// this.uncheckedData.splice(index, 1);
}
});