Это также происходило в отладочной версии флеш-плеера? Иногда ошибка не позволяет приложению правильно инициализироваться, и обычный игрок просто останавливается.
Проблема, вероятно, связана с вашим приложением - например, загрузка ресурсов, отправка URL-запросов, анализ flashVars - хотя это может быть непредсказуемым. Я не сталкивался с такой проблемой достаточно раз, чтобы помнить за два года разработки Flex, так что, по крайней мере, это не очень распространено.
Ведение журнала - хорошая идея - по крайней мере, проследите за событиями, такими как преинициализация и инициализация в вашем основном теге, чтобы увидеть, как далеко вы продвинулись.