Проблемы с открытием cmd?Исключение («Cmd {} не удалось: {}». Формат (cmd [0], stderr)) Исключение: Cmd * мой исполняемый файл * не выполнен: - PullRequest
Новая
       32

Проблемы с открытием cmd?Исключение («Cmd {} не удалось: {}». Формат (cmd [0], stderr)) Исключение: Cmd * мой исполняемый файл * не выполнен:

0 голосов
/ 03 марта 2019

Я, возможно, наткнулся на какой-то пост, который мог бы помочь мне решить мою проблему, но ничего, с чем я не смог с этим смириться.

Я пытаюсь протестировать установку с использованием исполняемого файла lyra.model.exe, но я продолжаю получать ошибки в точке, где (я полагаю, мой код пытается либо найти другой .exe, либо запустить какой-то другой.exe, называемый hmmsearch.

RUN 

lyra_model ./lyra_iedb/bcr_models/data/ex_kappa.fasta -o model.pdb

ВЫХОД

Файл "C: \ Users \ mvlor \ Desktop \ GAN-SPECIALPROJECT \ VirtualEnvironment \ tutorial-env \ lib \ site-packages \ bcr_models \ utils.py", строка 75, в run_cmd

повысить исключение ('Cmd {} не удалось: {}'. формат (cmd [0], stderr))
Исключение: ошибка Cmd hmmsearch:

Строки, указанные в utils.py , гласят: 

def run_cmd(cmd, input_string=''):
"""Run the cmd with input_string as stdin and return output."""
p = subprocess.Popen(cmd, stdout=subprocess.PIPE, stdin=subprocess.PIPE,
                     stderr=subprocess.PIPE, universal_newlines=True)
out, stderr = p.communicate(input=input_string)
if p.returncode:

** LINE 75 ** повысить исключение («Cmd {} не удалось: {}». Формат (cmd [0], stderr)) return out


Моя среда PATH должна быть правильно настроена для всех .exe, используемых программой, и при запуске mobaxterm, где яМы также включили все пути Windows

...