Вы можете просто переопределить Цветовой ресурс по умолчанию, добавив следующий код в App.xaml или на Страницу, где размещен элемент управления NavigationView.
в App.xaml
<Application.Resources>
<SolidColorBrush x:Key="NavigationViewSelectionIndicatorForeground" Color="Transparent" />
</Application.Resources>
ИЛИ на странице, где существует элемент управления NavigationView
<Page.Resources>
<SolidColorBrush x:Key="NavigationViewSelectionIndicatorForeground" Color="Transparent" />
</Page.Resources>