Это было решено!Решение состояло в том, чтобы создать виртуальную среду и загрузить необходимые пакеты в файле кода R.Если у других есть такая же проблема, вот соответствующий код для настройки виртуальной среды python для возможности развертывания в shinyapps.io:
virtualenv_create(envname = "python_environment", python= "python3")
virtualenv_install("python_environment", packages = c('keras', 'pandas','numpy','scipy','scikit-learn', 'tensorflow'))
reticulate::use_virtualenv("python_environment", required = TRUE)
Для ясности, конкретные пакеты - это именно то, что мой код на pythonнеобходимо.
Кроме того, вам может потребоваться запустить (а затем закомментировать для развертывания) следующую строку, чтобы использовать старую версию rsconnect, если вы получите сообщение об ошибке: reticulate is in use, but python was not specified
devtools::install_github("rstudio/rsconnect", ref='737cd48')