Используемое регулярное выражение будет
"^|$| "
, которое, когда нужно написать для редактора VIM, становится таким, как вам нужно экранировать |
с \
,
:%s/^\|$\| /\|/g
Откройте ваш файл, затем просто скопируйте вставить над строкой и нажмите Enter, что даст вам желаемый результат.