Пока нет способа выбрать пользовательскую корневую папку.Возможно, вы можете использовать произвольно выбранный путь, чтобы перейти непосредственно к вашему каталогу перед вызовом диалога.
Private Sub Button1_Click(ByVal sender As System.Object, ByVal e As System.EventArgs) Handles Button1.Click
FolderBrowserDialog1.SelectedPath = "Your Directory Path"
FolderBrowserDialog1.ShowDialog()
TextBox1.Text = FolderBrowserDialog1.SelectedPath
End Sub