Диагностика сходимости с помощью метода Гельмана-Рубина PSRF: R coda против Runjags - PullRequest
0 голосов
/ 04 марта 2019

Я запускаю байесовские модели с помощью Runjags, а затем конвертирую вывод в MCMC.list с пакетом coda.Я проверяю сходимость с помощью диагностики Гельмана-Рубина (одномерной).

Иногда PSRF является большим только потому, что цепочка выбрала большое значение в некоторой точке (PsRF идет от ~ 1 до 1,2).С другой стороны, PSRF близка к 1 с Runjags.Иногда у Runjags PSRF больше, чем у Coda.

Я не нашел разницу в вычислениях.Ты знаешь это?Можно ли думать, что параметр сходится из графиков, даже если PSRF равен 1,2?

...