Правильно распределите ваши переменные, установите правильные функции, следуйте правилам HTML (идентификаторы уникальны), используйте фреймворк в полной мере, и я бы посоветовал прекратить использовать JQuery, но так как вы его используете, давайте свернемсяс этим.
@HostListener('click', ['$event'])
click(event) {
const ID = Math.random().toString(36).slice(-8);
$(this._ElementRef.nativeElement).popover({
container: 'body',
html: true,
content: `
<div class="text-center">
<span class="d-block">Are you sure?</span>
<div class="btn-group btn-group-sm mt-1">
<button class="btn btn-outline-danger py-0" id="${ID}">Yes</button>
<button class="btn btn-outline-primary py-0">No</button>
</div>
</div>`,
placement: 'top',
trigger: 'focus',
boundary: 'window'
});
$('body').on('click', `#${ID}`, () => {
this.confirmed.emit();
});
}
Это связывает событие click с функцией, то есть вы создаете только всплывающее окно при нажатии, и оно уничтожается при подтверждении.Ваши идентификаторы становятся уникальными, не создавая больше конфликтов.Для этого они создаются динамически.