heatmap_ числовая матрица, содержащая категориальные значения - PullRequest
0 голосов
/ 04 марта 2019

Я пытаюсь создать тепловую карту из набора данных, но после импорта и преобразования в числовую матрицу все еще присутствуют некоторые переменные в виде символов, и поэтому они не отображаются в тепловой карте.

> data=as.matrix(Acc_Genes)
> str(data)
int [1:126, 1:24] 0 1 0 1 1 0 1 1 0 1 ...
 - attr(*, "dimnames")=List of 2
  ..$ : chr [1:126] "ISC01_ST11" "ISC02_ST11" "ISC03_ST11" "ISC08_ST11" ...
  ..$ : chr [1:24] "fimA" "fimB" "fimC" "fimD" ...
> is.numeric(data)

[1] TRUE
> heatmap(data)

> heatmap(data, scale="column")

тепловая карта:

heatmap

данные в виде матрицы, столбцы yfiN и allS в виде символов?

data as matrix, columns yfiN and allS as characters?

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...