aws s3 sync
копирует любые файлы, которые изменились в исходном местоположении, он НЕ удаляет ничего в целевом местоположении.
aws s3 sync --delete
копирует файлы, измененные в исходном местоположении, и УДАЛЯЕТ файлы из целевого расположения.местоположение, которое было удалено из источника.
aws s3 cp
копирует все файлы из источника в цель, независимо от их изменения в источнике, ничего не удаляет в цели.
aws s3 mv
перемещает измененные файлы от источника к цели и УДАЛЯЕТ соответствующие файлы в исходном местоположении.
Для получения дополнительной информации AWS имеет документацию по высокоуровневому использованию S3 CLI и болееподробная справка по CLI документация.