Использовать индексирование массива [1:-1]
для ссылки на внутренний массив.Например
a = np.zeros((5,5)) # Create an array of all zeros
print(a)
# [[0. 0. 0. 0. 0.]
# [0. 0. 0. 0. 0.]
# [0. 0. 0. 0. 0.]
# [0. 0. 0. 0. 0.]
# [0. 0. 0. 0. 0.]]
a[1:-1, 1:-1] = np.full((3,3), 7) # Assign the inner array to be a constant array of 7
print(a)
# [[0. 0. 0. 0. 0.]
# [0. 7. 7. 7. 0.]
# [0. 7. 7. 7. 0.]
# [0. 7. 7. 7. 0.]
# [0. 0. 0. 0. 0.]]