Это исчезнет, если вы установите прозрачный цвет фона:
yourEditText.setBackground(getResources().getDrawable(R.color.transparent));
где:
<color name="transparent">#00000000</color>
РЕДАКТИРОВАТЬ: После комментария Габриэле я снова зарегистрировался вмой проект, и я могу проверить, что вышеупомянутое решение работает для меня, пока я изменяю фон в представлении TextInputEditText напрямую, а не через TextInputLayout.Я думаю, что идея заключается в том, что цвет заменяет фон для рисования, который включает в себя подчеркивание, и, поскольку цвет прозрачен, представление сливается с фоном.
РЕДАКТИРОВАТЬ 2: Также то, что, кажется, работаетдля меня, если вы хотите редактировать содержащий макет вместо этого: mTextInputLayout.setBoxBackgroundMode(TextInputLayout.BOX_BACKGROUND_NONE);