Как использовать цикл внутри dplyr Summaze () - PullRequest
1 голос
/ 20 сентября 2019

Мне нужно подвести итог группы переменных после группировки.Есть пара переменных, к которым мне нужно применить разные функции, и около 25 переменных, к которым мне нужно применить одну и ту же функцию.На мой взгляд, это должно быть как-то оптимизировано, чтобы мне не приходилось вручную 25 раз писать имя новой переменной и операцию, которую необходимо выполнить для ее получения.

Я пробовал два варианта через пакет dplyr, но они не увенчались успехом.Мои попытки на примере игрушек представлены ниже:

library('dplyr')
df <- data.frame(letter = c('A', 'A', 'B', 'C', 'A', 'B'), 
                 group = c('group1', 'group1', 'group2', 'group3', 'group1', 'group2'),
                 var1= c(1,2,3,4,5,6), 
                 var2=c(6,6,6,6,6,6),
                 var3=c(2,2,2,2,2,2), 
                 var4=c(5,5,5,5,5,5))
var_names <-c('var2', 'var3', 'var4')
groupped <-df%>%
      group_by(letter, group)%>%
      summarise(var1_mean = mean(var1), 
                freq = n(),
                for (varp in var_names) {
                  nam <- paste(varp, "_sum", sep = "")
                  assign(nam, eval(parse(text=paste0("sum(", varp,")"))))
                }
                )

Я получил ошибку, что assign() не работает с dplyr, поэтому я попытался с этим:

groupped <- df%>%
  group_by(letter, group)%>%
  summarise(var1_mean = mean(var1), 
            freq=n(),
            for(i in vars){
            nam <- paste0("sum", i) 
            !!sym(nam) := sum(i)
             })

У меня есть идея, как выполнить эту задачу с помощью arrange() в цикле, привязав столбец за столбцом через cbind() к df, но это слишком неэффективно, так что простое создание 25 переменных вручную кажется более эффективным :)Есть идеи как автоматизировать этот процесс?

1 Ответ

1 голос
/ 20 сентября 2019

Вы можете использовать summarise_at для этой цели:

df %>% summarise_at(vars(var_names), list(mean = mean, sum = sum))

Если есть дополнительные функции, которые вы не хотите применять ко всем столбцам, вам нужно будет сделать это отдельно и left_joinрезультаты:

df %>% 
 group_by(letter, group) %>%
 summarise(freq = n()) %>%
 left_join(df %>% 
             group_by(letter, group)%>%
             summarise_at(vars(var_names), list(mean = mean, sum = sum)),
           by = c("letter", "group")
           )
...