ORTE_ERROR_LOG: распаковка данных будет считывать конец буфера в файле grpcomm_direct.c - PullRequest
Новая
       12

ORTE_ERROR_LOG: распаковка данных будет считывать конец буфера в файле grpcomm_direct.c

0 голосов
/ 26 сентября 2019

Open MPI Version: v4.0.0

Вывод ompi_info | head на двух машинах 

mpiuser@s2:~$ ssh s1 ompi_info | head
                 Package: Open MPI mpiuser@s1 Distribution
                Open MPI: 4.0.0
  Open MPI repo revision: v4.0.0
   Open MPI release date: Nov 12, 2018
                Open RTE: 4.0.0
  Open RTE repo revision: v4.0.0
   Open RTE release date: Nov 12, 2018
                    OPAL: 4.0.0
      OPAL repo revision: v4.0.0
       OPAL release date: Nov 12, 2018
mpiuser@s2:~$ ompi_info | head
                 Package: Open MPI mpiuser@s2 Distribution
                Open MPI: 4.0.0
  Open MPI repo revision: v4.0.0
   Open MPI release date: Nov 12, 2018
                Open RTE: 4.0.0
  Open RTE repo revision: v4.0.0
   Open RTE release date: Nov 12, 2018
                    OPAL: 4.0.0
      OPAL repo revision: v4.0.0
       OPAL release date: Nov 12, 2018

Оба установлены с использованием общей общей сети.

во время выполнения командына s1 (ведущий) 

mpiuser@s1:/disk3/cloud/openmpi-4.0.0/examples$ mpirun -n 2 ./hello
Hello, world, I am 1 of 2, (Open MPI v4.0.0, package: Open MPI mpiuser@s1 Distribution, ident: 4.0.0, repo rev: v4.0.0, Nov 12, 2018, 112)
Hello, world, I am 0 of 2, (Open MPI v4.0.0, package: Open MPI mpiuser@s1 Distribution, ident: 4.0.0, repo rev: v4.0.0, Nov 12, 2018, 112)

при выполнении команды отдельно на s2 (ведомый) 

mpiuser@s2:~/cloud$ mpirun -n 2 ./hello
Hello, world, I am 0 of 2, (Open MPI v4.0.0, package: Open MPI mpiuser@s2 Distribution, ident: 4.0.0, repo rev: v4.0.0, Nov 12, 2018, 113)
Hello, world, I am 1 of 2, (Open MPI v4.0.0, package: Open MPI mpiuser@s2 Distribution, ident: 4.0.0, repo rev: v4.0.0, Nov 12, 2018, 113)

Вывод команды hwloc на s2: 

mpiuser@s2:~/cloud/openmpi-4.0.0$ dpkg -l | grep hwloc
mpiuser@s2:~/cloud/openmpi-4.0.0$

Вывод команды hwloc для s1: 

mpiuser@s1:/disk3/cloud/openmpi-4.0.0/examples$ dpkg -l | grep hwloc
mpiuser@s1:/disk3/cloud/openmpi-4.0.0/examples$

Обе машины работают на Ubuntu 16.04.5 LTS

, но при выполнении команды на распределенной системе выдает следующую ошибку 

mpiuser@s1:/disk3/cloud/openmpi-4.0.0/examples$ mpirun -host s1,s2 ./hello
[s2:26283] [[40517,0],1] ORTE_ERROR_LOG: Data unpack would read past end of buffer in file grpcomm_direct.c at line 355
--------------------------------------------------------------------------
An internal error has occurred in ORTE:

[[40517,0],1] FORCE-TERMINATE AT Data unpack would read past end of buffer:-26 - error grpcomm_direct.c(359)

This is something that should be reported to the developers.
--------------------------------------------------------------------------
...