Я использую pyenv для управления установками python и виртуальными средами - и я хотел бы, чтобы anaconda была одной из таких установок, и чтобы я мог создавать виртуальные среды, используя anaconda python.Использование pyenv install anaconda3-2019.03 успешно устанавливает, и я могу активировать версию с помощью pyenv global anaconda3-2019.03:
SamLee-PC:~ max$ pyenv versions
system
2.7.10
2.7.10/envs/flask_tutorial
* 3.7.4 (set by /Users/max/.pyenv/version)
3.7.4/envs/learning_python
3.7.4/envs/microblog
3.7.4/envs/stocktool
3.7.4/envs/test1
anaconda3-2019.03
anaconda3-2019.03/envs/datsci
datsci
flask_tutorial
learning_python
microblog
stocktool
test1
SamLee-PC:~ max$ pyenv which python
/Users/max/.pyenv/versions/3.7.4/bin/python
SamLee-PC:~ max$ pyenv global anaconda3-2019.03
(anaconda3-2019.03) SamLee-PC:~ max$ pyenv which python
/Users/max/.pyenv/versions/anaconda3-2019.03/bin/python
(anaconda3-2019.03) SamLee-PC:~ max$ pyenv which conda
/Users/max/.pyenv/versions/anaconda3-2019.03/bin/conda
(я не знаю, почему версия python добавляется в командную строку только при установке anaconda)
Когда я создаю новую виртуальную среду (pyenv virtualenv anaconda3-2019.03 datsci), она, кажется, работает как задумано:
SamLee-PC:~ max$ pyenv which python
/Users/max/.pyenv/versions/3.7.4/bin/python
SamLee-PC:~ max$ cd code/linkedin/datsci
(datsci) SamLee-PC:datsci max$ pyenv which python
/Users/max/.pyenv/versions/datsci/bin/python
(datsci) SamLee-PC:datsci max$
Это то же относительное местоположение, возвращаемое pyenv which python в других моих виртуальных средах,все они работают правильно.
Проблема в том, что версия python, запускаемая в виртуальной среде, не имеет доступа ко всем пакетам anaconda:
(datsci) SamLee-PC:datsci max$ anaconda-navigator
pyenv: anaconda-navigator: command not found
The `anaconda-navigator' command exists in these Python versions:
anaconda3-2019.03
(datsci) SamLee-PC:datsci max$
хотя это происходит, если я активирую установку python вручную:
SamLee-PC:~ max$ pyenv global anaconda3-2019.03
(anaconda3-2019.03) SamLee-PC:~ max$ anaconda-navigator
WARNING: The conda.compat module is deprecated and will be removed in a future release.
/Users/max/.pyenv/versions/anaconda3-2019.03/lib/python3.7/site-packages/anaconda_navigator/api/conda_api.py:1364: YAMLLoadWarning: calling yaml.load() without Loader=... is deprecated, as the default Loader is unsafe. Please read https://msg.pyyaml.org/load for full details.
data = yaml.load(f)
2019-09-21 14:03:38,666 - ERROR download_api._download:234
Invalid url https://www.anaconda.com/wp-content/uploads/2017/05/Webinar20-20Three20Ways20to20Move20your20Data20Science20Projects20to20Production.png
#anaconda navigator GUI opens
(как ни странно, версия python, на которую datsci указывает , , кажется, распознает conda:
(datsci) SamLee-PC:datsci max$ pyenv which python
/Users/max/.pyenv/versions/datsci/bin/python
(datsci) SamLee-PC:datsci max$ conda
usage: conda [-h] [-V] command ...
conda is a tool for managing and deploying applications, environments and packages.
...
Проблема в том, что, насколько я понимаю, активация версии python таким образом, когда я хочу анаконду, означает, что у меня есть доступ только к одной версии анаконды питона - что противоречит целииспользование его в виртуальной среде.
Еще одна часть головоломки - я заметил, что для других моих виртуальных сред ~/.pyenv/versions/name-of-virtualenv содержит файл pyvenv.cfg, который содержит, например, следующее:
1 home = /Users/max/.pyenv/versions/3.7.4/bin
2 include-system-site-packages = false
3 version = 3.7.4
Не было такого файла в ~/.pyenv/versions/datsci, поэтому я добавил один:
1 home = /Users/max/.pyenv/versions/anaconda3-2019.03/bin
2 include-system-site-packages = false
3 version = anaconda3-2019.03
безрезультатно.
ПОКАЗАТЬ содержимое этого каталога:
(anaconda3-2019.03) SamLee-PC:datsci max$ pwd
/Users/max/.pyenv/versions/datsci
(anaconda3-2019.03) SamLee-PC:datsci max$ ls
bin conda-meta include lib pyvenv.cfg share ssl
(anaconda3-2019.03) SamLee-PC:datsci max$
Интересно, у меня неправильное содержимое в файле pyvenv.cfg для datsci ... но я в растерянности.
Мне действительно нравится, как работает pyenv, и я бы хотелпродолжайте использовать это.Есть ли способ настроить anaconda для правильного поведения под pyenv?
Обновление:
Я удалил anaconda, управляемую pyenv, и заново установил в соответствии с рекомендациями Симбы.Теперь по умолчанию pyenv определяет активную установку python, и я могу активировать conda с помощью conda activate base:
Maxs-MacBook-Air:~ max$ which python
/Users/max/.pyenv/shims/python
Maxs-MacBook-Air:~ max$ conda activate base
(base) Maxs-MacBook-Air:~ max$ which python
/Users/max/anaconda3/bin/python
(base) Maxs-MacBook-Air:~ max$
Однако после создания новой среды conda с conda create --name datsci, новой condaсреда, кажется, не активируется должным образом:
Maxs-MacBook-Air:~ max$ conda activate datsci
(datsci) Maxs-MacBook-Air:~ max$ which python
/Users/max/.pyenv/shims/python
Чего мне не хватает?
Вот содержимое моего .bash_profile:
1 export PATH="/Users/max/.pyenv/bin:$PATH"
2 eval "$(pyenv init -)"
3 eval "$(pyenv virtualenv-init -)"
4
5 # >>> conda initialize >>>
6 # !! Contents within this block are managed by 'conda init' !!
7 __conda_setup="$('/Users/max/anaconda3/bin/conda' 'shell.bash' 'hook' 2> /dev/null)"
8 if [ $? -eq 0 ]; then
9 eval "$__conda_setup"
10 else
11 if [ -f "/Users/max/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh" ]; then
12 . "/Users/max/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh"
13 else
14 export PATH="/Users/max/anaconda3/bin:$PATH"
15 fi
16 fi
17 unset __conda_setup
18 # <<< conda initialize <<<
Это важночтобы я продублировал оператор if, найденный в .bash_profile?
обновлении 2 Симбы:
Проблема решена, мне пришлось установить python в новой среде.