Когда вы добавляете оба приложения в admob, каждое с разными именами пакетов, для каждого из ваших приложений будет создан уникальный идентификатор.Вам придется использовать эти идентификаторы.Если вы используете один и тот же идентификатор в нескольких проектах, единственным проектом, в котором будут показываться объявления, будет тот, имя пакета которого совпадает с именем пакета, зарегистрированным для этого admob-id.