Загрузите содержимое вашего txt-файла и журналы ошибок.
string = open("verhaaltje.txt", "r")
words = [word for word in string.read().split() if len(word)==3]
string.close()
print (str(words))
С моим вышеуказанным кодом и текстом из Интернета я получил
['the', 'the', 'the', 'm).', 'the', 'the', 'The', 'its', 'ago', 'was', 'm),', 'but', 'now', 'm).', 'and', 'its', 'big', 'but', 'the', 'are', 'and', 'its', 'the', 'and', 'for']
Для новой строки, немного измените оператор print.
print ('\n'.join(words))