У меня была эта проблема с отдельным почтовым комплектом java, отличным от моего комплекта активации java. У вас есть следующие опции, чтобы получить 1 пакет для просмотра файлов (т.е. не ресурсов Java, а таких вещей, как файлы XML) в META-INF других пакетов.
1) Слить связки вместе. Это часто нелогично иметь дело или просто невозможно для проекта.
2) Пусть пакеты, которые должны совместно использовать ресурсы, должны быть фрагментами пакета, которые должны считывать ресурсы. Фрагменты пакета определяются спецификацией OSGi и позволяют отдельным пакетам совместно использовать ресурсы, как если бы они были объединены вместе.