С API DataStream вы можете просто сделать что-то вроде этого:
streamFromKafka = env.addSource(new FlinkKafkaConsumer<>(inputTopic, ...));
streamFromKafka
... // one set of operations
.addSink(new FlinkKafkaProducer<>(outputTopic1, ...));
streamFromKafka
... // another set of operations
.addSink(new FlinkKafkaProducer<>(outputTopic2, ...));
Вам придется немного отрегулировать это, чтобы использовать API таблицы, но принцип тот же.