Единственное, что приходит мне в голову - это пропустить их через оболочку.
Было бы:
<?php
$output = shell_exec('python testScript.py');
echo $output;
?>
Он не слишком интегрирован с phpunit, но как только вы получите вывод в переменную ($ output), вы можете затем проанализировать текст внутри него, чтобы увидеть, есть ли у вас "E" или "." («E» указывает на ошибки в pyunit и «.» Указывает на проход).
Это лучшее, что я могу придумать, надеюсь, это поможет.