Эти приложения считаются устаревшими в последней версии OpenCV, учитывая удаление устаревшего API C. Смотрите этот выпуск на Github. Если вы действительно хотите включить их в свою сборку, попробуйте выполнить следующие действия:
В вашей папке source/apps файл CMakeLists.txt, видимый здесь в Github, должен:быть изменены. В частности, каталоги traincascade и createsamples не добавляются, но закомментированы в конце файла:
#ocv_add_app(traincascade) # <--- Uncomment these two lines
#ocv_add_app(createsamples) # <---
ocv_add_app(annotation)
ocv_add_app(visualisation)
ocv_add_app(interactive-calibration)
ocv_add_app(version)
Если вы раскомментируете эти строки, соответствующие каталоги будут проходить в CMake ипроекты будут включены.