Использование GridSearchCV с IsolationForest для поиска выбросов - PullRequest
10 голосов
/ 01 октября 2019

Я хочу использовать IsolationForest для нахождения выбросов. Я хочу найти лучшие параметры для модели с GridSearchCV. Проблема в том, что я всегда получаю одну и ту же ошибку:

TypeError: If no scoring is specified, the estimator passed should have a 'score' method. The estimator IsolationForest(behaviour='old', bootstrap=False, contamination='legacy',
                max_features=1.0, max_samples='auto', n_estimators=100,
                n_jobs=None, random_state=None, verbose=0, warm_start=False) does not.

Кажется, это проблема, потому что IsolationForest не имеет score метода. Есть ли способ это исправить? Также есть ли способ найти оценку для изоляции леса? Это мой код:

import pandas as pd
from sklearn.ensemble import IsolationForest
from sklearn.model_selection import GridSearchCV

df = pd.DataFrame({'first': [-112,0,1,28,5,6,3,5,4,2,7,5,1,3,2,2,5,2,42,84,13,43,13],
                   'second': [42,1,2,85,2,4,6,8,3,5,7,3,64,1,4,1,2,4,13,1,0,40,9],
                   'third': [3,4,7,74,3,8,2,4,7,1,53,6,5,5,59,0,5,12,65,4,3,4,11],
                   'result': [5,2,3,0.04,3,4,3,125,6,6,0.8,9,1,4,59,12,1,4,0,8,5,4,1]})

x = df.iloc[:,:-1]

tuned = {'n_estimators':[70,80,100,120,150,200], 'max_samples':['auto', 1,3,5,7,10],
         'contamination':['legacy', 'outo'], 'max_features':[1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,13,15],
         'bootstrap':[True,False], 'n_jobs':[None,1,2,3,4,5,6,7,8,10,15,20,25,30], 'behaviour':['old', 'new'],
         'random_state':[None,1,5,10,42], 'verbose':[0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10], 'warm_start':[True,False]}

isolation_forest = GridSearchCV(IsolationForest(), tuned)

model = isolation_forest.fit(x)

list_of_val = [[1,35,3], [3,4,5], [1,4,66], [4,6,1], [135,5,0]]
df['outliers'] = model.predict(x)
df['outliers'] = df['outliers'].map({-1: 'outlier', 1: 'good'})

print(model.best_params_)
print(df)

Ответы [ 2 ]

8 голосов
/ 04 октября 2019

Вам необходимо создать собственную функцию оценки, поскольку IsolationForest не имеет встроенного метода score. Вместо этого вы можете использовать функцию score_samples, которая доступна в IsolationForest (может рассматриваться как прокси для score), и создать собственного счетчика, как описано здесь , и передать его GridSearchCV. Я изменил ваш код, чтобы сделать это:

import pandas as pd
import numpy as np
from sklearn.ensemble import IsolationForest
from sklearn.model_selection import GridSearchCV

df = pd.DataFrame({'first': [-112,0,1,28,5,6,3,5,4,2,7,5,1,3,2,2,5,2,42,84,13,43,13],
                   'second': [42,1,2,85,2,4,6,8,3,5,7,3,64,1,4,1,2,4,13,1,0,40,9],
                   'third': [3,4,7,74,3,8,2,4,7,1,53,6,5,5,59,0,5,12,65,4,3,4,11],
                   'result': [5,2,3,0.04,3,4,3,125,6,6,0.8,9,1,4,59,12,1,4,0,8,5,4,1]})

x = df.iloc[:,:-1]

tuned = {'n_estimators':[70,80], 'max_samples':['auto'],
     'contamination':['legacy'], 'max_features':[1],
     'bootstrap':[True], 'n_jobs':[None,1,2], 'behaviour':['old'],
     'random_state':[None,1,], 'verbose':[0,1,2], 'warm_start':[True]}  

def scorer_f(estimator, X):   #your own scorer
      return np.mean(estimator.score_samples(X))

#or you could use a lambda aexpression as shown below
#scorer = lambda est, data: np.mean(est.score_samples(data)) 

isolation_forest = GridSearchCV(IsolationForest(), tuned, scoring=scorer_f)
model = isolation_forest.fit(x)

ВЫБОР ОБРАЗЦА

print(model.best_params_)

{'behaviour': 'old',
 'bootstrap': True,
 'contamination': 'legacy',
 'max_features': 1,
 'max_samples': 'auto',
 'n_estimators': 70,
 'n_jobs': None,
 'random_state': None,
 'verbose': 1,
 'warm_start': True}

Надеюсь, это поможет!

0 голосов
/ 01 октября 2019

Я считаю, что оценка относится к объекту GridSearchCV, а не к IsolationForest.

Если установлено значение «Нет» (по умолчанию), оно будет пытаться использовать оценку оценок, которая, как вы заявляете, не существует. Попробуйте использовать одну из доступных метрик оценки , подходящую для вашей проблемы, в объекте GridSearchCV

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...