Здесь atu.testng.reports.utils.SettingsFile.open()
код пытается открыть файл с некоторыми "настройками". Я полагаю, что ваш рефакторинг вызвал переименование этого файла или какой-либо строки, содержащей путь к этому файлу (рефакторинг может не просто переименовать ваши классы, но и изменить внутренний текст строк, если вы недостаточно внимательны).
ИтакМой совет - проверить, какой путь распространяется к этому методу и откуда, и проверить, является ли путь действительно правильным.